盤古神殿本是盤古的心臟所化，其中的盤古精血誕生出了十二祖巫與后卿，十二祖巫相繼死去之后，盤古神殿落在了后卿的手中。

為了獲得更強大的實力，后卿將盤古神殿之中的精血全部吸收，使得盤古神殿化為了一座尋常的宮殿，但依舊是巫族的圣地。

可惜后來蚩尤戰(zhàn)敗給軒轅，盤古神殿也在戰(zhàn)斗中被波及，失去盤古精血，神殿便如一座普通石頭堆成的石殿，其中大部分被紅云收下，只有一些小碎片被不愿融入人族的巫族人帶到了十萬大山。