宋朝時以衍圣公或孔氏族人任曲阜令，所謂“國朝以來，世以孔氏子孫知仙源縣，使奉承廟祀”，且衍圣公多兼曲阜令。

但到了元朝實行“世封其大宗為衍圣公以奉祀事，世任其小宗為曲阜尹”的制度。

所謂“小宗”，專指孔元用后裔特別是孔治的子孫。

到了明朝，小宗世襲縣尹制度改為世職知縣。

但這知縣的位置還是從小宗里面選任，孔希荀作為大宗，自然是想要將這個權利拿過來。