申佰祥的妻子乃是與他同甘共苦的糟糠之妻，在潞合時便為他養(yǎng)育一女，同他一起去往遠京后，又為他育得一子一女，只可惜他的長子出生還未有多久，便因病去世。

所幸申佰祥的仕途當時還算順利，他的兩個女兒也平安長大，原本他在潞合城中購置了一處宅邸，給父母居住，但父親病亡后，他就將老母也接到了遠京享福，三世同堂；而他的長女年十七時，嫁給了戶部侍郎之子，嫁入了世家盛家。